NCI使用BioMark基因工程系统开展研究

　　集成流体通路将促使有希望的基因易感性标记物更快发布

　　美国国立卫生研究院(National Institutes of Health，NIH)下属的主要癌症研究机构国家癌症研究所（National Cancer Institute，NCI）日前表示，该机构正在使用Fluidigm公司的BioMark基因工程系统，以高成本效益对其全基因组单核苷酸多态性（SNP）联合扫描的结果进行快速、深入的研究。

　　美国国家癌症研究所的核心基因分型技术中心（Core Genotyping Facility）采用Fluidigm公司的BioMark 96.96动态阵列，进行中等数量的多重（medium-plex）单核苷酸多态性基因分型。国家癌症研究所正在进行多项全基因组联合扫描（GWAS）。上述计划的主要目标是，加快联合扫描中发现的有希望的基因易感性标记物的复制和发布工作。

　　Fluidigm公司总裁兼首席执行官Gajus Worthington说，“Fluidigm的新型96.96动态阵列能够帮助国家癌症研究所大幅提高其癌症基因分型研究的服务能力。他们使用本公司48.48阵列以来一直都很顺利，在他们进行的比较测试中，Fluidigm的新型96.96阵列的表现极为突出。”

　　Worthington又说，“国家癌症研究所的核心基因分型技术中心与其他政府研究中心和学术机构的研究人员展开合作，共同开发用于辨别具体形式的癌症的易感个体筛查技术。我们的96.96动态阵列的检出率（call rate）达到99%以上，一天能够处理70000多个基因型。”

　　美国国家癌症研究所已完成一项前列腺癌全基因组联合扫描的后续深入研究，使用了近60种SNP，用标准的5'-核酸酶聚合酶链式反应（PCR）化学技术和BioMark™动态阵列，对15000个试样进行了测定。2008年6月1日，在西班牙巴塞罗那举行的欧洲人类遗传学学会2008年年会上，美国国家癌症研究所基因组扫描操作与分析研究带头人Kevin Jacobs介绍了本次研究的结果。

　　Fluidigm公司发明了集成流体通路（integrated fluidic circuit，IFC）。该公司的的BioMark系统采用集成流体通路技术来简化操作，提高通量，实现纳升级的精密度，并能为高通量的基因分型应用节省大量成本（试剂用量更少，试样更小）。使用Fluidigm公司的新款96.96动态阵列，国家癌症研究所能够借助96组引物-探针组合来测定96个试样，一次产生9216个反应。集成流体通路只需要192步移液操作（与之相比，如果在384个微井的标准板片上进行这样规模的试验，需要完成18000多步移液操作）。