scRNA-seq技术的进展及其在癌症研究中的应用

1scRNA-seq技术的进展及其在癌症研究中的应用

内容概要：介绍了scRNA-seq技术的基本过程和发展，并探讨了其在癌症研究和临床实践中的应用。癌症是一组异质性疾病，scRNA-seq技术可以帮助我们理解肿瘤异质性和肿瘤微环境，从而更好地了解肿瘤发生、进展、转移和药物耐受性的机制。

2内源性腺嘌呤介导糖尿病模型的肾损伤并预测患者的糖尿病肾病

内容概要：研究了糖尿病患者中内源性腺嘌呤的作用，发现尿腺嘌呤/肌酐比值（urine adenine/creatinine ratio，UAdCR）可能是末期肾病（end-stage kidney disease，ESKD）的机制生物标志物。此外，腺嘌呤通过哺乳动物雷帕霉素靶蛋白（mammalian target of rapamycinm，mTOR）刺激肾小管细胞中的基质生成，并在小鼠肾脏中刺激mTOR。

3肺泡巨噬细胞的训练免疫通过KLF4-MERTK介导的吞噬作用增强损伤修复

内容概要：通过转录组分析和功能实验发现，经过细菌内毒素或铜绿假单胞菌预处理的肺泡巨噬细胞（alveolar macrophages，AMs）表现出更强的抵抗病原体诱导的细胞死亡的能力。AMs的重编程通过转录因子KLF4介导了吞噬作用受体MERTK的表达上调。将这些训练后的AMs移植到暴露于致命铜绿假单胞菌的受体小鼠中，可以限制炎症性肺损伤。

4临床介导的CD8+ T细胞和NK细胞中的焦亡作用通过单细胞和bulk测序揭示黑色素瘤的异质性

内容概要：通过单细胞转录组和bulk RNA-seq的综合分析，发现黑色素瘤组织中免疫细胞（如CD8+ T细胞和NK细胞）的存在减少可能会降低焦亡的能力，从而对抗黑色素瘤的能力也会降低。此外，研究还构建了一个预后风险模型和个性化诊断图表，表明焦亡相关基因在恶性黑色素瘤预防中可能发挥重要作用。

5单细胞转录组学揭示重症肌无力危象中的高细胞介质症的外周免疫景观

内容概要：利用单细胞转录组学和免疫库测序技术，发现在危机期和危机后，存在一种名为单核细胞3（FCGR3B单核细胞）的独特亚群，其表达了的促炎症信号通路。此外，年龄相关的B细胞和CD4、CD8 T细胞存在自身免疫活性和持续的T细胞疲劳。这些结果表明，肌无力危象中的先天免疫激活与高细胞介质症有关。

6单细胞转录组学揭示急性髓性白血病患者化疗后外周血单核细胞的免疫细胞异质性

内容概要：使用scRNA-seq技术，发现急性髓系白血病（acute myeloid leukaemia，AML）患者的T细胞、NK细胞、单核细胞、树突状细胞（dendritic cells，DCs）和造血干细胞祖细胞（haematopoietic stem cell progenitors，HSC-Prog）的亚群簇多样性存在差异。NK细胞和单核细胞-DCs在转录因子表达和染色体拷贝数变异（chromosome copy number variation，CNV）方面表现出变化。HSC-Prog细胞中的CNV和细胞间相互作用网络也存在的异质性。