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NGS技术发现老年弥漫性大B细胞淋巴瘤新型预后标志物

文章来源:健康界发布日期:2023-03-09浏览次数:48

研究亮点

1、揭示FAT4基因突变在DLBCL中是一个有利的预后生物标志物,尤其对于老年患者。

2、基于NGS检测和临床信息,综合对比分析了老年和青年DLBCL患者的临床和分子特征差异。

研究内容

148例初治DLBCL患者均采用了标准/减低剂量R-CHOP方案或R-COP方案进行一线治疗,其中23例进行了自体干细胞移植。80例(诊断时年龄超过60岁)为老年组,其余68例为青年组。老年组IPI(≥3)和ECOG评分(≥2)更高,MYC/BCL2双表达患者也较多,而在血清LDH水平、Ann Arbor分期、原发肿瘤部位、结外肿瘤数量、COO分型等方面两组间无明显差异。本研究采用血默胜™大Panel对所有患者石蜡包埋切片(FFPE)样本进行NGS测序,并将整个队列中突变频率超过10%的基因定义为“高频突变”。

研究结果

老年和青年DLBCL患者的分子特征

148例初治DLBCL常见的突变基因为PIM1(43.9%)和KMT2D(31.8%),其次是MYD88(29.7%)和CD79B(27.0%)。对比老年和青年组的突变差异,其中ATM(p=0.008)、DNMT3A(p=0.016)突变仅在老年组中检出,而B2M(p=0.020)、CD70(p=0.035)、NFKBIA(p=0.024)和STAT6(p=0.024)突变则在青年组中更常见。进一步通路分析发现,免疫逃逸通路(包含B2M和CD70)在青年组中富集(p=0.032),而老年组中表观遗传调控相关基因突变比例更高(p=0.03)。

FAT4突变是DLBCL的预后良好因素

为了探索DLBCL中潜在的预后生物标志物,研究者首先基于基线临床特征和12个常见突变基因(突变频率≥20%)对无进展生存时间(PFS)进行单因素分析,结果如表1所示,COO分型、Ann Arbor分期、IPI评分、TP53和FAT4突变(校正后p<0.1)与PFS相关。由于Ann Arbor分期是IPI评分的因素之一,故在多因素分析时将其排除,而COO分型、IPI评分、TP53和FAT4突变仍然是预测PFS的独立预后因素,且FAT4突变患者PFS更长。

TP53突变已被多次证明是预后不良的指标,并与疾病进展相关,而血液肿瘤中FAT4突变的预后作用从未被报道,因此研究者深入分析本队列中FAT4的突变情况。FAT4是FAT家族的一员,该家族编码具有Cadherin重复序列、EGF样结构域和Laminin G样结构域的大型跨膜蛋白。本队列中大多数FAT4突变是跨越整个蛋白结构的错义突变,除一个复发突变P136Q外没有热点(图2A)。基因互作分析发现,除了与CREBBP有互斥趋势(p<0.1)外,FAT4突变与其他基因突变没有明显的互斥或共突变。然而,TP53突变与PIM1、CD79B、BTG2和CDKN2A突变互斥,而PIM1常与MYD88、CD79B、BTG1/2和ETV6共突变(p<0.05)。

FAT4突变是PFS的有利因素,那是否会进一步影响到OS呢?多因素分析显示,PFS中的4个预后因素在预测OS时保持独立的预后价值。接下来,研究者分别对这4个因素在老年和青年亚组中的预后作用进行了探究,由于老年组中IPI评分<3的患者未发生死亡事件,因此Cox回归模型不适用于OS分析,但IPI评分≥3的患者OS较差。在老年组中,多因素分析显示IPI评分、TP53和FAT4突变仍是PFS的独立预后因素,而FAT4突变在青年组中不再与更好的PFS或OS相关,这表明老年和青年DLBCL患者之间存在遗传特征的差异。

此外,携带FAT4突变的TP53野生型老年患者(TP53wt/FAT4mut)的生存好,OS长于TP53/FAT4双野生型或双突变的老年患者。以上结果共同表明,FAT4基因是老年DLBCL患者新的预后因素,但仍无法逆转TP53突变的不良预后影响。

结语

NGS技术加速了对DLBCL的分子特征研究,能够辅助发现新的预后生物标志物,指导预后分层和疾病监测,但尚未在传统临床环境中得到充分应用。本研究基于真实世界DLBCL治疗随访数据,证明了老年DLBCL患者中FAT4突变提示预后更佳,携带FAT4突变且TP53野生型老年患者(TP53wt/FAT4mut)生存好。研究成果促进了对DLBCL复杂分子机制的理解,并为预后判断及临床治疗提供了新的思路。